>>それらはサーバ上で処理するしかなくなってしまう
確かに、それだとSaaSになりますよね……
個人的には單位計算などのJSは今まで通り利用したらいいと思ひます。
JSが必要な物はJSをピンポイントで使用して、さらにlibreJSみたいな仕組みでユーザーが同意したJSだけを實行できるのが理想的です。

或は、HTML+JSによく似た、手輕にGUIを構築できてウェブ經由で配信できるスクリプト言語があれば良いかもしれません。
↑現狀、HTML+JSがいちばん現實的なんですよね……そこはわかります。